Общество
15.11.2023 в 15:29
Лекарственные растения Бурятии попали под сканер
Необычный проект реализуют ученые БГСХА и Института общей и экспериментальной биологии СО РАН
Текст: Дмитрий Родионов
Ученые Бурятской сельхозакадемии совместно с Институтом общей и экспериментальной биологии СО РАН создают гербарий лекарственных растений Забайкалья. Первые 97 образцов уже переданы для оцифровки. Среди них - ценные растения: родиола розовая, шлемник байкальский, софора желтоватая, астрагал перепончатый, и другие виды ценной лекарственной флоры, в том числе растения из Красной книги.
«Для создания цифрового гербария в этом году были организованы экспедиции по всей территории Бурятии и части Забайкальского края ((Агинский, Мугойтуйский и Шилкинский районы).). Акцент сделали на редкие и исчезающие лекарственные растения, которые имеют спрос в западной и восточной медицине», - рассказывает о проекте научный сотрудник лаборатория медико-биологических исследований ИОЭБ СО РАН, к.б.н. Вячеслав Шишмарёв.
Это коллекция засушенных растений, препарированных в согласии с определёнными правилами. Обычно гербарные образцы после высушивания монтируются на листах плотной бумаги и в зависимости от вида растения на гербарном листе может быть представлена целая особь, группа особей или часть крупного растения. Обязательным элементов любого гербарного листа является этикетка, на которой указаны названия растения на латинском и русском языках, название семейства, дата сбора, место обитания, фамилия сборщика.
А вот «цифровые двойники» растений переводят проект на совершенно другой уровень. Для того, чтобы узнать, как выглядит и где произрастает, к примеру, мак голостебельный (лат. Papaver nudicaule), можно будет с любой точки мира просто открыть его скан и узнать – где растет, чем ценится, как используется. Более того, есть возможность рассмотреть растение в мельчайших деталях в 3D- формате.
«Цифровой гербарий лекарственных растений Забайкалья создаётся на комплексе планетарного сканирования «ЭларСкан», который приобретен в рамках проекта Приоритет 2030, - рассказывает автор проекта, директор научной библиотеки Евгения Вершинина. - Это оборудование сканирует изображение в очень высоком разрешении, с точной цветопередачей, что дает возможность полноценно работать с образцами, использовать их не только в образовательных, но и научных целях».
В настоящее время на платформе Бурятской ГСХА разрабатывается прототип ресурса. По задумке авторов, информационная система предполагает быть обширной, с возможностью расширенного поиска. Помимо основных сведений для каждого растения – названия вида на латинском и русском языках, семейства, его синонимов, будут созданы дополнительные разделы - «применение в медицине», «применение кроме медицины», «в ветеринарии и производстве кормовых добавок», «биологическая активность», «противопоказания», «способы заготовки сырья», и другие параметры, которые будут интересны не только ученым, но и обычным пользователям.
По словам авторов проекта, важную часть работы составляет географическая привязка растения к точным координатам места произрастания и сбора. Так что скоро цифровая коллекция лекарственной флоры Забайкалья дополнит виртуальный гербарий мира.
Что отличает разрабатываемую информационную систему от подобных аналогов в стране и за рубежом – это гибридный вариант, когда сведения о гербарных образцах напрямую связаны с полнотекстовой электронной библиотекой БГСХА, научными публикациями сотрудников, различными учебно-методическими материалами и др.
Информационный продукт предполагает авторизацию в системе, возможность сохранения найденных ресурсов, интерактивного общения, комментария и других опций.
На этой базе данных планируется создавать другие популярные проекты, развивать сетевое сотрудничество с различными научными и образовательными организациями, создавать различные мобильные приложения, к примеру, использовать цифровые образцы для идентификации и распознавания растений по фото (по типу инструмента Pl@ntNet).
«Для создания цифрового гербария в этом году были организованы экспедиции по всей территории Бурятии и части Забайкальского края ((Агинский, Мугойтуйский и Шилкинский районы).). Акцент сделали на редкие и исчезающие лекарственные растения, которые имеют спрос в западной и восточной медицине», - рассказывает о проекте научный сотрудник лаборатория медико-биологических исследований ИОЭБ СО РАН, к.б.н. Вячеслав Шишмарёв.
«Сбор растений для гербария - дело достаточно кропотливое. Нужно подгадать с погодой – она должна быть солнечная, со временем сбора – чтобы растения находились в фазе массового цветения. Для гербария следует выбирать экземпляры без повреждений (насекомыми, грибами и т.п.). Если растения в популяции заметно различаются, то в гербарии желательно представить особи разных форм, демонстрирующие варьирование признаков. В случае травянистых растений (за исключением крупных видов) в гербарий надо брать всё растение, включая подземные органы. При гербаризации кустарников и деревьев достаточно взять веточку или побег. В любом случае желательно наличие на образцах генеративных органов - цветков, плодов, спорангиев.
Собираем сразу по несколько экземпляров, минимум три четыре, чтобы были дубликаты. Растения прокладываем несколькими слоями бумаги, закладываем в гербарные сетки, а после просушки уже монтируем гербарные листы», - делится процессом заготовки научный сотрудник лаборатории медико-биологических исследований ИОЭБ СО РАН, к. фарм.н. Татьяна Шишмарёва.
Это коллекция засушенных растений, препарированных в согласии с определёнными правилами. Обычно гербарные образцы после высушивания монтируются на листах плотной бумаги и в зависимости от вида растения на гербарном листе может быть представлена целая особь, группа особей или часть крупного растения. Обязательным элементов любого гербарного листа является этикетка, на которой указаны названия растения на латинском и русском языках, название семейства, дата сбора, место обитания, фамилия сборщика.
А вот «цифровые двойники» растений переводят проект на совершенно другой уровень. Для того, чтобы узнать, как выглядит и где произрастает, к примеру, мак голостебельный (лат. Papaver nudicaule), можно будет с любой точки мира просто открыть его скан и узнать – где растет, чем ценится, как используется. Более того, есть возможность рассмотреть растение в мельчайших деталях в 3D- формате.
«Цифровой гербарий лекарственных растений Забайкалья создаётся на комплексе планетарного сканирования «ЭларСкан», который приобретен в рамках проекта Приоритет 2030, - рассказывает автор проекта, директор научной библиотеки Евгения Вершинина. - Это оборудование сканирует изображение в очень высоком разрешении, с точной цветопередачей, что дает возможность полноценно работать с образцами, использовать их не только в образовательных, но и научных целях».
В настоящее время на платформе Бурятской ГСХА разрабатывается прототип ресурса. По задумке авторов, информационная система предполагает быть обширной, с возможностью расширенного поиска. Помимо основных сведений для каждого растения – названия вида на латинском и русском языках, семейства, его синонимов, будут созданы дополнительные разделы - «применение в медицине», «применение кроме медицины», «в ветеринарии и производстве кормовых добавок», «биологическая активность», «противопоказания», «способы заготовки сырья», и другие параметры, которые будут интересны не только ученым, но и обычным пользователям.
По словам авторов проекта, важную часть работы составляет географическая привязка растения к точным координатам места произрастания и сбора. Так что скоро цифровая коллекция лекарственной флоры Забайкалья дополнит виртуальный гербарий мира.
Что отличает разрабатываемую информационную систему от подобных аналогов в стране и за рубежом – это гибридный вариант, когда сведения о гербарных образцах напрямую связаны с полнотекстовой электронной библиотекой БГСХА, научными публикациями сотрудников, различными учебно-методическими материалами и др.
Информационный продукт предполагает авторизацию в системе, возможность сохранения найденных ресурсов, интерактивного общения, комментария и других опций.
На этой базе данных планируется создавать другие популярные проекты, развивать сетевое сотрудничество с различными научными и образовательными организациями, создавать различные мобильные приложения, к примеру, использовать цифровые образцы для идентификации и распознавания растений по фото (по типу инструмента Pl@ntNet).
В перспективе, академия планирует все свои архивные материалы, музейные экспонаты, биологические и медицинские коллекции, начиная от микроорганизмов до внутренних органов животных, перевести в цифровой формат и сделать доступной для широкого пользователя.
Напомним, проект «Открытая библиотека открытой науки» был запущен Бурятской сельхозакадемией в 2023 году благодаря программе Приоритет 2030 ДВ. Реализация проекта включает ряд этапов, в том числе модернизацию цифрового пространства библиотеки, создание в академии единой информационной платформы доступа к цифровым ресурсам и сервисам.
Фото: Ларисы Бочановой
Теги
растение